Effekten av BOTOX^® bygges opp over tid. Visse pasienter kan trenge tre injeksjonssykluser for å nå klinisk relevant forbedring. Effekten av en BOTOX^®-behandling varer i cirka tre måneder. Behandling må derfor som regel gjentas hver tredje måned.

Ved vedvarende spastisitet i bena hos barn som har cerebral parese, merkes forbedringen vanligvis innen de to første ukene etter injeksjonen.

Ved vedvarende spastisitet i håndledd og hånd og fot og ankel hos pasienter som har hatt slag, vil en forbedring vanligvis merkes innen de 2 første ukene etter injeksjonen. Den maksimale effekten merkes vanligvis omtrent 4 til 6 uker etter behandlingen. De fleste pasienter injiseres igjen etter mellom 12 og 16 uker. Behandling bør ikke gis oftere enn hver 12. uke.

Ved vedvarende spastisitet i øyelokk og ansikt merkes klinisk effekt innen 3 dager etter injeksjonen, og maksimal effekt merkes vanligvis etter 1 til 2 uker.

Ved vedvarende spastisitet i nakke og skuldre merkes klinisk effekt innen 2 uker etter injeksjonen. Den maksimale effekten merkes vanligvis omtrent 6 uker etter behandlingen.

Ved urinlekkasje på grunn av overaktiv blære merkes klinisk effekt innen 2 uker etter injeksjonen. Vanligvis varer effekten omtrent 6–7 måneder etter injeksjonen.

Ved urinveislekkasje på grunn av problemer med urinblæren som forbindes med ryggmargsskade eller multippel sklerose merkes klinisk effekt innen 2 uker etter injeksjonen. Vanligvis varer effekten omtrent 8–9 måneder etter injeksjonen.

For kraftig svette i armhulene merkes klinisk effekt innen den første uken etter injeksjonen. Vanligvis varer effekten i gjennomsnitt 7,5 måneder etter den første injeksjonen, og omtrent 1 av 4 pasienter merker fremdeles effekt etter et år.